No começo do século XIX, teve início o povoamento do território, integrante do município de Jacaraci, por fazendeiros que alí se fixaram, desenvolvendo a agropecuária. Em 1886, Balbino Coelho comprou o sítio Lagoa da Malva onde se estabeleceu com sua família, e dos irmãos Carvalho. Formou-se então o povoado de Boa Vista, em 1892. No mesmo ano, Júlio Carvalho instalou uma loja de tecidos, iniciando o comércio do povoado. Em 1921 foi contruída a capela de São José e, em 1930 a primeira Escola Pública, o distrito foi criado com nome de “Tabajara” em 1938 pela lei nº 11.089. Em 1943, alterou-se o topônimo para Mortugaba. O município desmenbrado do de Jacaraci foi criado em 30 de novembro de 1961 pela lei nº 1.566. Tendo como primeiro Prefeito o Sr. Israel Silva.
Origem do nome
O nome Mortugaba é de origem indígena Tupi, o vocábulo significa habitação do povo.
